模拟离子液体时离子对的3d结构能直接从pubchem等数据库下载吗...

来自 : muchong.com/html/201406/75581. 发布时间：2021-03-24

引用回帖:5楼: Originally posted by amo11000 at 2014-06-21 08:29:54
可用于gromacs吗？收费吗？
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parachem是免费的，beeMD也是免费的，用于Gromacs要自己改格式，相应体系中的其它部分也要用CHARMM的力场。希望你使用BeeMD，我们的软件比Gromacs最加灵活的，对国内用户来说也有最好的支持，你的使用即时对我们开发工作的最大支持，请关注我们的进展，我们即将写些更多的离子液体计算模拟的相关应用例子。
BeeMD发布贴：
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7512802 amp;fpage=1
BeeMD开发团队
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2014年6月21日parachem是免费的,beeMD也是免费的,用于Gromacs要自己改格式,相应体系中的其它部分也要用CHARMM的力场。希望你使用BeeMD,我们的软件比Gromacs最加灵活...小木虫,小木虫论坛,论文,投稿,基金,化学,化工,材料,学术,科学,科研,博士,硕士,教育,理工,论文翻译,论文润色，期刊各位高人：小弟最近在学习模拟离子液体+-，但不知道离子对+-的初始结构是怎么来的。看了很多文献，一般是通过Gaussian软件绘制后经优化获得，但小弟发现许多数据库中已经有了这些离子对的3d结构，可不可用直接从pubchem等数据库下载后直接用于模拟呢？这样免去了自己绘制的麻烦。殷切盼望各位高人的解答。谢谢！模拟离子液体时离子对的3d结构能直接从pubchem等数据库下载吗？